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医疗健康中的机器学习

Machine Learning for Healthcare6.S897麻省理工Spring 2019免费
风险分层临床 NLP医学影像因果推断公平性

这门课学什么

这门课讲机器学习怎样用在临床数据上。内容包括风险分层、疾病进展建模、临床 NLP、医学影像、因果推断、治疗决策的强化学习、公平性和可解释性。OCW 有讲座视频和讲义,部分讲座请临床医生讲。

内容摘要

这门课讲机器学习怎样用在真实医疗数据上,以及医疗场景为什么比一般场景难。前 3 讲先讲医疗本身:诊疗流程怎样运作,电子病历有什么结构和缺陷。没有这层背景,模型很容易学到错误的规律。

第 4–13 讲按任务展开:风险分层、生理时间序列、临床文本处理和技术落地,再请心脏病学、病理学、乳腺影像领域的嘉宾讲具体应用。第 14–20 讲转向方法:因果推断、强化学习、疾病进展与亚型建模、精准医疗。最后 5 讲讨论上线问题:流程自动化、监管、公平性、数据集偏移和可解释性。

课程常请波士顿地区的临床医生和研究者讲课或担任讨论嘉宾。学生课前要回答阅读问题。每个学生还要整理一讲的课堂笔记,或参加一次社区晚间活动,和医生讨论实际问题。

作业有 6 次习题。课程项目使用真实临床数据,从提案、展示到报告完整走一遍。成绩构成是作业 40%、项目 40%、课堂参与 20%。学完后,你能识别临床数据中的常见陷阱,能用因果推断和强化学习的思路分析治疗决策,并能判断一个医疗 AI 模型是否可以上线。

两位讲师分工明确:Sontag 主讲机器学习方法,Szolovits 有几十年医疗信息学经验,常讲临床背景和历史经验。

为什么值得学

医疗领域出错的代价落在真人身上。这门课认真讲因果推断和公平性,同类公开课很少。

课程信息

学校
麻省理工(MIT)
课程号
6.S897
讲师
大卫·桑塔格(David Sontag)、彼得·绍洛维茨(Peter Szolovits)
学期
Spring 2019
平台
MIT OpenCourseWare
费用
免费
难度
高级
学时
25 讲
先修
学过机器学习入门课。
材料
视频、讲义
许可证
CC BY-NC-SA 4.0
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课程是英文的。本页的介绍、摘要和大纲由极客教育原创撰写,讲次标题为中文意译。开课时间、收费和链接以官方页面为准。

课程大纲 · 共 25 节

大纲依据:Spring 2019 OCW Calendar 讲次列表(查看原始页面 ↗)

  1. 1
    导论:医疗有什么特殊Introduction: What Makes Healthcare Unique?

    讲医疗数据和医疗决策与其他机器学习场景的区别,并介绍课程安排。

  2. 2
    临床诊疗概览Overview of Clinical Care

    讲医疗体系怎样运作:医生怎样诊断和治疗,数据在哪些环节产生。

  3. 3
    深入临床数据Deep Dive into Clinical Data

    讲电子病历、检验结果、诊断编码和影像这几类数据的结构和缺陷。

  4. 4
    风险分层(上)Risk Stratification, Part 1

    讲怎样用病历数据预测患者未来发病或恶化的风险。

  5. 5
    风险分层(下)Risk Stratification, Part 2

    讲生存分析,以及风险模型的评估和校准。

  6. 6
    生理时间序列Physiological Time-Series

    讲心电、重症监护这类连续生理信号的建模方法。

  7. 7
    临床自然语言处理(上)Natural Language Processing (NLP), Part 1

    讲从临床文本中抽取信息,主要用规则和传统统计方法。

  8. 8
    临床自然语言处理(下)Natural Language Processing (NLP), Part 2

    讲词向量和深度学习方法在临床文本中的用法。

  9. 9
    把技术带进临床Translating Technology into the Clinic

    讲模型进入医院时遇到的流程、激励和工程问题。

  10. 10
    机器学习用于心脏病学Machine Learning for Cardiology

    嘉宾讲用深度学习分析心脏影像。

  11. 11
    机器学习用于鉴别诊断Machine Learning for Differential Diagnosis

    讲根据症状和检查结果列出可能诊断的模型,从早期专家系统讲到概率模型。

  12. 12
    机器学习用于病理学Machine Learning for Pathology

    嘉宾讲用深度学习分析病理切片。

  13. 13
    机器学习用于乳腺 X 线摄影Machine Learning for Mammography

    嘉宾讲用深度学习做乳腺癌筛查和风险评估。

  14. 14
    因果推断(上)Causal Inference, Part 1

    讲怎样从观察数据估计治疗效果,引入潜在结果框架和混杂因素。

  15. 15
    因果推断(下)Causal Inference, Part 2

    讲倾向评分、匹配和逆概率加权这几类估计方法。

  16. 16
    强化学习(上)Reinforcement Learning, Part 1

    讲把连续多步的治疗决策写成强化学习问题,以及只用历史数据评估策略的难点。

  17. 17
    强化学习(下)Reinforcement Learning, Part 2

    嘉宾讲怎样评估动态治疗策略。

  18. 18
    疾病进展与亚型(上)Disease Progression & Subtyping, Part 1

    讲用纵向数据刻画慢性病怎样随时间发展。

  19. 19
    疾病进展与亚型(下)Disease Progression & Subtyping, Part 2

    讲从数据中发现疾病亚型,并同时建模每个亚型的进展轨迹。

  20. 20
    精准医疗Precision Medicine

    讲结合基因和临床数据为个体选择治疗方案。

  21. 21
    临床流程自动化Automating Clinical Workflows

    讲用机器学习自动完成临床流程中的重复环节。

  22. 22
    美国对 ML/AI 的监管;人类受试者研究Regulation of ML/AI in the US; Human Subjects Research

    两位嘉宾分别讲医疗 AI 软件的监管审批,以及涉及人类受试者的研究要遵守的伦理规则。

  23. 23
    公平性Fairness

    讲模型在不同人群上表现不一致的来源和度量方法。

  24. 24
    应对数据集偏移Robustness to Dataset Shift

    讲模型换一家医院或换一个时期后性能下降的原因和应对方法。

  25. 25
    可解释性Interpretability

    讲怎样让医生理解和信任模型的预测。

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